123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1635 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 328 aa  686    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 318 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  25.84 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  25.49 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  25.08 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  24.11 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  22.26 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  24.02 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  23.94 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  22.87 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  22.53 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  23.35 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  21.81 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  25.48 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  22.15 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  22.61 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  32.32 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  22.38 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  32.32 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  23.94 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  22.53 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  20.21 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  22.39 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 348 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  20.58 
 
 		 398 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  29.17 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  23.11 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  22.8 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  21.63 
 
 		 362 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.61 
 
 		 510 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.48 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  24.45 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 233 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  23.13 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  23.28 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  20.73 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  21.69 
 
 		 352 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.79 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  19.93 
 
 		 352 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  31.63 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  34.41 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  32.32 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  22.58 
 
 		 224 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 238 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  33.7 
 
 		 238 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  28.42 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  22.44 
 
 		 397 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  21.92 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  21.43 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  27.86 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 645 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  28.42 
 
 		 640 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  22.62 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 		 660 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  19.48 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  21.79 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  25 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3402  hypothetical protein  20.75 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  22.44 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  22.86 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  19.03 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>