249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0110 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 316 aa  629  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  66.45 
 
 		 318 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  60.52 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  58.58 
 
 		 353 aa  363  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  51.92 
 
 		 322 aa  332  5e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  51.6 
 
 		 672 aa  312  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  48.83 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  34.56 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 398 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 398 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  33.23 
 
 		 398 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 400 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  33.23 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.16 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  28.41 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  32.06 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  25.57 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  29.04 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 239 aa  93.6  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  32.92 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  29.25 
 
 		 239 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  26.52 
 
 		 590 aa  89.4  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  42.34 
 
 		 233 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  42.34 
 
 		 233 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 352 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  23.84 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  31.46 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  24.56 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  33.59 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  26.33 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  19.02 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  22.3 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  38.6 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  23 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  22.65 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  22.65 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  25.26 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  26.33 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  34.82 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  40.4 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  37 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  37.39 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  37.39 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  37.39 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>