217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1065 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 386 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 		 318 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 		 322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  34.1 
 
 		 672 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  28.39 
 
 		 354 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  22.06 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  30.79 
 
 		 400 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 400 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 397 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  28.41 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  24.26 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  24.74 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 321 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24.19 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  31.21 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  22.33 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  32.7 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  29.07 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  31.7 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  26.34 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 354 aa  68.9  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  26 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  23.1 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.99 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  26.07 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  27.31 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  23.44 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  33.67 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  24.9 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  32.69 
 
 		 590 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  20.77 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 1015 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  36.84 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  23.19 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  22.71 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  38.28 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  22.97 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  22.71 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  22.71 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  34.41 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  19.8 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  35.79 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>