More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0918 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  51.85 
 
 
224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 
238 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  34.8 
 
 
238 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  40.09 
 
 
282 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  31.06 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
249 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 
239 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  31.19 
 
 
233 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  37.67 
 
 
278 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
244 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
244 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
244 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  31.19 
 
 
233 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
253 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  37.66 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
244 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
1001 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  27.95 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 
279 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
1015 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  32.44 
 
 
274 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  34.63 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
316 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 
626 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  30.67 
 
 
590 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  31.47 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.47 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  33 
 
 
510 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 
289 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
254 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 
319 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  30.51 
 
 
256 aa  105  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 
283 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 
336 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 
319 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 
266 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 
321 aa  101  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 
272 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 
645 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  32.26 
 
 
295 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
275 aa  96.3  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
274 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
615 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
615 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
285 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  29 
 
 
318 aa  92.4  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  29.79 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
297 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  30 
 
 
357 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 
274 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 
278 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
348 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
295 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  30.21 
 
 
320 aa  87.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 
426 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
273 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 
305 aa  86.3  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 
354 aa  85.5  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  29.09 
 
 
348 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 
348 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  24.3 
 
 
289 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  29.63 
 
 
273 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 
313 aa  85.1  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 
415 aa  85.1  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  30.85 
 
 
373 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 
339 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  27.73 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  29.09 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  27.6 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.31 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  25.34 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
659 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  27.07 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  25.42 
 
 
391 aa  82.4  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.19 
 
 
258 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
689 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  25.51 
 
 
276 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  31.39 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.07 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.07 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 
660 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 
659 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>