More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1976 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 257 aa  536  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  78.28 
 
 		 249 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  63.22 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  48.05 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  46.72 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  46.72 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  49.79 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  49.37 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  46.19 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  47.46 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  47.46 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  44.35 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  44.35 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  43.91 
 
 		 244 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 233 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  34.84 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  29.36 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.05 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  35.12 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  37.95 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 316 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 1015 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  29.41 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28.4 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  28.74 
 
 		 590 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 278 aa  99  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 1001 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 598 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 		 510 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 415 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 626 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  29.75 
 
 		 360 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.06 
 
 		 409 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.06 
 
 		 409 aa  89  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  29.17 
 
 		 360 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.06 
 
 		 409 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  29.34 
 
 		 358 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  31.06 
 
 		 409 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 297 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  30.91 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 360 aa  85.5  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 		 276 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 		 353 aa  85.1  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.63 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  26.55 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.26 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.21 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  28.57 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  28.57 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  28.21 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  28.21 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  30.21 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  30.21 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  25.89 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  26.89 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  25.91 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  25.09 
 
 		 672 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  27.69 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  27.69 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  25.45 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  27.35 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  25.45 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  25.45 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 689 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  23.76 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>