230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1967 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 339 aa  695    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  60.54 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  56.87 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  53.04 
 
 		 353 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  51.48 
 
 		 672 aa  311  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  50.16 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  47.81 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  31.83 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.99 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  30.06 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  31.23 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 350 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  31.95 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  31.25 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 398 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 408 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  26.6 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  29.64 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  25.15 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 351 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  26.22 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  24.92 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  23.84 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  22.94 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  23.96 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  34.96 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  34.96 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  24.46 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  23.64 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  25.08 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  24.02 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  23.64 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  23.64 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  38.68 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  33.08 
 
 		 249 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  23.9 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  24.17 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  25.3 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  32.12 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.18 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14351  hypothetical protein  23.14 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  32.82 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  24.01 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  22.95 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  26.8 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  25.3 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28.46 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  43.4 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  36.19 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>