More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0414 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
233 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  61.8 
 
 
233 aa  308  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  61.8 
 
 
233 aa  307  6.999999999999999e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  50.87 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  48.6 
 
 
244 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  48.6 
 
 
244 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  48.13 
 
 
244 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  47 
 
 
239 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  43.23 
 
 
253 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  39.83 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  45.62 
 
 
238 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  45.62 
 
 
238 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 
249 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  38.63 
 
 
239 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  38.2 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
224 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 
238 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 
270 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  34.25 
 
 
264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 
321 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
274 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 
255 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.47 
 
 
306 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.47 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 
336 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
1001 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 
289 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  30.17 
 
 
261 aa  106  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 
626 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
319 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
1015 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  29.28 
 
 
590 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
234 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 
415 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 
283 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 
274 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.33 
 
 
409 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 
407 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  31.42 
 
 
289 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.47 
 
 
407 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
598 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.76 
 
 
409 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  30.9 
 
 
409 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  29.87 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 
275 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  31.03 
 
 
409 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.76 
 
 
409 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.76 
 
 
409 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.17 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  32.76 
 
 
409 aa  92  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
437 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  30 
 
 
417 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  30 
 
 
417 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
426 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  32.33 
 
 
409 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 
409 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  32.33 
 
 
409 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 
409 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 
510 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  28.45 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  31.65 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 
278 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  31.22 
 
 
360 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 
361 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  31.65 
 
 
360 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  28.83 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  31.22 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 
360 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
348 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 
659 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  26.22 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  26.22 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 
659 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
689 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 
660 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  27.62 
 
 
295 aa  72  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0625  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 
266 aa  71.6  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0292231  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  26.7 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>