More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1587 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 626 aa  1252    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 234 aa  116  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 		 266 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 249 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 253 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  35.65 
 
 		 239 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  33.48 
 
 		 239 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 224 aa  107  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 233 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  33.48 
 
 		 239 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  28.32 
 
 		 306 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 244 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.88 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 244 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 1001 aa  105  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 		 244 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  36.82 
 
 		 264 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  26.76 
 
 		 261 aa  102  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 278 aa  101  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 		 333 aa  101  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 		 244 aa  101  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 238 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  34.4 
 
 		 238 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  36.78 
 
 		 255 aa  99.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  32.11 
 
 		 233 aa  99.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  32.11 
 
 		 233 aa  99.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 270 aa  98.6  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 283 aa  98.6  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 279 aa  98.6  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 		 278 aa  98.6  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 		 1015 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 289 aa  97.8  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 319 aa  97.4  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.04 
 
 		 272 aa  95.5  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 289 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 251 aa  93.2  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 257 aa  92.8  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 		 282 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 		 455 aa  90.9  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 274 aa  90.9  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 		 336 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  25.56 
 
 		 290 aa  90.1  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  25.56 
 
 		 290 aa  90.1  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 249 aa  88.6  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  29.67 
 
 		 590 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 276 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 		 276 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 884 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 		 659 aa  84  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 		 660 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 		 316 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  27.27 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 659 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.87 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  31.8 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  25.21 
 
 		 265 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 270 aa  79.7  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  29.5 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 645 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 615 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 673 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 615 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.09 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 327 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.05 
 
 		 327 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.93 
 
 		 327 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 289 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  31.09 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  37.84 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.39 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  37.84 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  28.35 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.84 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.05 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.84 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  27.03 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>