208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0792 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 278 aa  557  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  64.56 
 
 		 289 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  34.89 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  37.21 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 224 aa  119  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  35.08 
 
 		 1015 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 		 626 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  31.05 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  31.05 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 257 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 598 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 689 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 239 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 244 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 249 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 244 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 233 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 1001 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  29.09 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  26.42 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  29.34 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  28.21 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  29.49 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  29.61 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  26.53 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.86 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  25.43 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 510 aa  75.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  25.75 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25.75 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.26 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  25.75 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  41.94 
 
 		 397 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25.32 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  29.65 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 398 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  26.24 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  24.74 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  23.04 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 659 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 660 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  25.14 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  23.48 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  23.5 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  23.5 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  22.65 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 659 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  18.85 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>