More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0156 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
276 aa  569  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  48.53 
 
 
276 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  49.26 
 
 
276 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  44.64 
 
 
284 aa  251  6e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  45 
 
 
285 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  44.29 
 
 
284 aa  249  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  45.38 
 
 
273 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  44.57 
 
 
273 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  44.57 
 
 
273 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  44.57 
 
 
273 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  42.86 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  43.61 
 
 
273 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  43.23 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  43.23 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  43.23 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  36.9 
 
 
256 aa  190  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  37.08 
 
 
256 aa  183  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 
270 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  36.97 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 
279 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  26.8 
 
 
373 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 
319 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  23.98 
 
 
271 aa  102  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
278 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  35.18 
 
 
266 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  25.09 
 
 
266 aa  99  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.49 
 
 
237 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  25.09 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  34.94 
 
 
383 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  23.9 
 
 
327 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 
401 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 
274 aa  92.4  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 
321 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 
373 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.3 
 
 
409 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  26.47 
 
 
363 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  22.03 
 
 
298 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  28.23 
 
 
233 aa  89  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  23.72 
 
 
306 aa  89  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.73 
 
 
409 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  31.33 
 
 
409 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  29.03 
 
 
233 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  27.03 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  23.32 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.33 
 
 
409 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
366 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 
347 aa  85.5  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  31.33 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  31.33 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  32.92 
 
 
548 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  32.92 
 
 
548 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  23.51 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 
407 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  25.85 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  27.34 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.6 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
1001 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.2 
 
 
407 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 
348 aa  79  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 
238 aa  79  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 
289 aa  79  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  29.51 
 
 
238 aa  79  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  29.2 
 
 
409 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  29.2 
 
 
409 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  24.47 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  25.59 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 
615 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 
615 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 
627 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
437 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  28.69 
 
 
417 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  28.69 
 
 
417 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>