More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1580 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 598 aa  1184    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  52.17 
 
 		 623 aa  280  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  48.86 
 
 		 313 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  53.49 
 
 		 315 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  48.08 
 
 		 315 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  46.77 
 
 		 337 aa  250  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6856  glycosyl transferase family 2  42.26 
 
 		 328 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6733  glycosyl transferase family 2  42.02 
 
 		 333 aa  227  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2677  glycosyl transferase family protein  45.82 
 
 		 317 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3928  glycosyl transferase family 2  48.15 
 
 		 532 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  47.79 
 
 		 281 aa  204  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3846  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 311 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  38.73 
 
 		 1132 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  41.39 
 
 		 318 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 319 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 		 274 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  33.75 
 
 		 322 aa  141  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 		 310 aa  141  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.09 
 
 		 331 aa  137  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 		 310 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 		 310 aa  136  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 307 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 289 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 		 283 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  40.19 
 
 		 264 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 282 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 		 278 aa  108  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 319 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 289 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 		 270 aa  106  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 321 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 305 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 		 261 aa  103  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 		 253 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  33.08 
 
 		 310 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 		 279 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  44 
 
 		 271 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.01 
 
 		 306 aa  98.6  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.11 
 
 		 306 aa  97.8  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 309 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 310 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 305 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 255 aa  97.1  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 233 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 251 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 239 aa  94.7  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 312 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 257 aa  93.6  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 313 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 		 500 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 271 aa  92.8  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 249 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  31.31 
 
 		 239 aa  91.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 254 aa  92  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 		 296 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  29.68 
 
 		 233 aa  90.5  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 		 313 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 		 313 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 311 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  29.22 
 
 		 233 aa  88.2  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 310 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 278 aa  87.8  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  32.09 
 
 		 238 aa  87  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 238 aa  87  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.96 
 
 		 224 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 313 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 239 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  28.96 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 275 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  26.97 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 244 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  39.06 
 
 		 630 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 244 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  31.42 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 		 924 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 626 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2851  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000258612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  25.59 
 
 		 361 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 1015 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  39.68 
 
 		 630 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  30.19 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  26.39 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>