More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3615 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
319 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  32.48 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  37.08 
 
 
279 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.07 
 
 
306 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  33.6 
 
 
282 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  39.35 
 
 
278 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 
321 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  34.2 
 
 
261 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
266 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 
255 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  35.86 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
1015 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 
271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
645 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
275 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
224 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 
316 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  37.88 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  34.68 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 
627 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  30.08 
 
 
590 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  33.95 
 
 
238 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  33.95 
 
 
238 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 
291 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 
256 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.94 
 
 
283 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  31.65 
 
 
233 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  31.65 
 
 
233 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 
615 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  30.2 
 
 
360 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 
615 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
272 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  30.45 
 
 
360 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  29.55 
 
 
284 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
598 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 
257 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
233 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 
284 aa  105  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 
234 aa  105  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 
354 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  30.45 
 
 
360 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 
285 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
358 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  29.39 
 
 
360 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 
510 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  28.7 
 
 
256 aa  103  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 
276 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 
361 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 
401 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 
276 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  26.83 
 
 
273 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  26.83 
 
 
273 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  26.83 
 
 
273 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 
251 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
265 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  29 
 
 
273 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 
249 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 
239 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
270 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  27.93 
 
 
239 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  28.69 
 
 
373 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 
415 aa  99.4  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
1001 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  26.42 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
244 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  28.04 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 
626 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  28.84 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 
234 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 
274 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  29.21 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
426 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 
249 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 
373 aa  93.2  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
244 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  27.35 
 
 
276 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
244 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
244 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  30.6 
 
 
349 aa  92.8  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
298 aa  92.8  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
353 aa  92.4  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  31.66 
 
 
320 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 
270 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  30.19 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.82 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  27.38 
 
 
673 aa  90.5  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>