More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2112 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 320 aa  660    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  73.04 
 
 		 319 aa  499  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  47.21 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  43.45 
 
 		 318 aa  294  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0375  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0881899  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  28.66 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.03 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 348 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  26.44 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.89 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  31.3 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  30.23 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 352 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 234 aa  87.4  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 224 aa  85.9  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 615 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 615 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  26.4 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 627 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  27.19 
 
 		 590 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  26.5 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28.26 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  28.26 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  28.64 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 		 628 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.84 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.05 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  28.18 
 
 		 378 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  28.18 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  30.16 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  23.35 
 
 		 645 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  30.16 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  25.39 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  30.16 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  30.16 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  28.18 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  25.35 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  25 
 
 		 640 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  25.82 
 
 		 673 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  25.82 
 
 		 673 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  25.82 
 
 		 673 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  24.36 
 
 		 672 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 		 1015 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.76 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  24.36 
 
 		 672 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  23.71 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  24.36 
 
 		 672 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  24.36 
 
 		 672 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  24.36 
 
 		 672 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  24.36 
 
 		 672 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  24.36 
 
 		 672 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 		 659 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 		 660 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  23.21 
 
 		 724 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  25.34 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0448  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.3 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  22.57 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  25 
 
 		 671 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  23.72 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>