219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4286 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  50.82 
 
 		 672 aa  714    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  50.82 
 
 		 672 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  90.76 
 
 		 671 aa  1266    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  60.21 
 
 		 673 aa  842    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  50.82 
 
 		 672 aa  714    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  50.82 
 
 		 672 aa  714    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  55.12 
 
 		 665 aa  753    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  60.21 
 
 		 673 aa  842    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  100 
 
 		 671 aa  1377    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  50.67 
 
 		 672 aa  714    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  60.21 
 
 		 673 aa  842    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  50.82 
 
 		 672 aa  714    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  50.67 
 
 		 672 aa  711    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  45.23 
 
 		 724 aa  535  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  44.36 
 
 		 695 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  44.33 
 
 		 712 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  44.33 
 
 		 712 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  44.14 
 
 		 697 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  43.67 
 
 		 698 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  43.52 
 
 		 697 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  43.67 
 
 		 697 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  43.67 
 
 		 697 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  43.57 
 
 		 640 aa  498  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  43.21 
 
 		 697 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  41.88 
 
 		 659 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  41.88 
 
 		 660 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  41.72 
 
 		 659 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  38.09 
 
 		 673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  39.27 
 
 		 624 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  39.37 
 
 		 684 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  38.25 
 
 		 628 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 298 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 373 aa  110  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  28.98 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  28.41 
 
 		 278 aa  97.8  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.4 
 
 		 237 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  25.79 
 
 		 306 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 296 aa  95.5  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.4 
 
 		 306 aa  95.1  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 		 615 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 		 615 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.1 
 
 		 363 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 279 aa  89.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 282 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0711  xylanase/chitin deacetylase  25.96 
 
 		 315 aa  87.4  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.485406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 627 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  27.67 
 
 		 273 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  27.67 
 
 		 273 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 319 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.67 
 
 		 273 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.67 
 
 		 273 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 645 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  23.05 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  23.05 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 		 548 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 		 548 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  20.67 
 
 		 289 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 264 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.17 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  23.87 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  27.11 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  25.1 
 
 		 256 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 426 aa  73.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 278 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  20.87 
 
 		 336 aa  72.8  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  25.21 
 
 		 256 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 371 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 		 316 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 255 aa  72  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  22.5 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  21.77 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.23 
 
 		 319 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  24.61 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  23.49 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  23.26 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  25.69 
 
 		 590 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 1015 aa  68.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  23.18 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  24.7 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  24.7 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  23.62 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  23.62 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  24.7 
 
 		 310 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>