209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0178 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  48.87 
 
 		 672 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  48.87 
 
 		 672 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  100 
 
 		 665 aa  1358    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  54.07 
 
 		 671 aa  737    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  48.87 
 
 		 672 aa  669    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  48.71 
 
 		 672 aa  669    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  55.3 
 
 		 671 aa  740    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  58.94 
 
 		 673 aa  825    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  58.94 
 
 		 673 aa  825    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  58.94 
 
 		 673 aa  825    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  48.87 
 
 		 672 aa  669    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  49.02 
 
 		 672 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  48.87 
 
 		 672 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  46.14 
 
 		 697 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  44.64 
 
 		 695 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  46.38 
 
 		 724 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  43.89 
 
 		 697 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  43.74 
 
 		 697 aa  528  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  43.32 
 
 		 698 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  45.4 
 
 		 640 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  43.74 
 
 		 697 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  45.18 
 
 		 712 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  43.74 
 
 		 697 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  45.18 
 
 		 712 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  43.26 
 
 		 659 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  42.59 
 
 		 660 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  42.59 
 
 		 659 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  39.71 
 
 		 624 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  40.1 
 
 		 628 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  35.66 
 
 		 673 aa  432  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  39.64 
 
 		 684 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  28.39 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  22.51 
 
 		 298 aa  104  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.02 
 
 		 273 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.02 
 
 		 273 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 357 aa  90.5  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  26.21 
 
 		 273 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 		 354 aa  88.6  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 264 aa  87.8  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  27.42 
 
 		 273 aa  87.4  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  23.35 
 
 		 306 aa  87  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 		 296 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  29.72 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  22.71 
 
 		 319 aa  86.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  22.96 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  25.75 
 
 		 278 aa  83.2  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  29.03 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.1 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  28.05 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  28.05 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  24.39 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  25.4 
 
 		 348 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 		 274 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2763  hypothetical protein  28.41 
 
 		 395 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.14621e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  28.92 
 
 		 273 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 		 370 aa  80.1  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 321 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  25.56 
 
 		 363 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 371 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  23.13 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.35 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  25.53 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  25.53 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  22.53 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24.33 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  23.94 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 353 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 645 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  24.08 
 
 		 348 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  23.71 
 
 		 282 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  27 
 
 		 548 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 		 319 aa  73.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 548 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  22.58 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  22.59 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 264 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  22.36 
 
 		 273 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  22.88 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  22.88 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  23.05 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  22.63 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  22.57 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  25.09 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  22.8 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>