253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0976 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  77.37 
 
 
295 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  76.64 
 
 
273 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  74.9 
 
 
258 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  67.15 
 
 
264 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  74.26 
 
 
262 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 
278 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  56.25 
 
 
256 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  44.02 
 
 
357 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  43.14 
 
 
263 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  43.14 
 
 
263 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  40.37 
 
 
296 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  44 
 
 
395 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  44 
 
 
437 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  43.59 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  44 
 
 
274 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  44 
 
 
274 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  39.11 
 
 
264 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  44 
 
 
437 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  44 
 
 
378 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  44 
 
 
296 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35 
 
 
554 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1030  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.14 
 
 
617 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  35 
 
 
279 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0448  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.02 
 
 
456 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0150  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  32.91 
 
 
306 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  33.05 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
373 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
348 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 
370 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  27.66 
 
 
318 aa  102  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
348 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 
352 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
348 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
279 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 
348 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
348 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 
321 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  27.6 
 
 
391 aa  98.6  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.28 
 
 
363 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 
348 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
349 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
348 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 
319 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 
381 aa  95.5  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
645 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  28.77 
 
 
357 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
353 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  27.14 
 
 
348 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
348 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 
319 aa  92.8  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 
348 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  29.38 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
510 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  26.44 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  29.38 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  30.14 
 
 
349 aa  90.5  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 
627 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
354 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 
234 aa  89  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.65 
 
 
319 aa  89  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  23.36 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
342 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  24.83 
 
 
624 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 
615 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 
615 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  25.1 
 
 
640 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 
316 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  27.82 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
1015 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  23.36 
 
 
665 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  28.39 
 
 
488 aa  82.4  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.94 
 
 
409 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  26.14 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 
628 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  28.65 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  27.02 
 
 
409 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  22.92 
 
 
672 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  22.92 
 
 
672 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  22.92 
 
 
672 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  22.92 
 
 
672 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  22.92 
 
 
672 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  22.92 
 
 
672 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  23.23 
 
 
672 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>