249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0897 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 264 aa  540  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  84.87 
 
 		 258 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  75 
 
 		 274 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  69.88 
 
 		 295 aa  367  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  70.76 
 
 		 273 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  63.52 
 
 		 262 aa  331  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  54.46 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  54.46 
 
 		 256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  47.41 
 
 		 357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  43.77 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  42.75 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  48.07 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  42.75 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  45.68 
 
 		 395 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  45.68 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  45.68 
 
 		 437 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  45.68 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  45.73 
 
 		 437 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  45.73 
 
 		 378 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  45.73 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  42.75 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0448  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.02 
 
 		 456 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.56 
 
 		 554 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  37.75 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1030  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.56 
 
 		 617 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0150  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.35 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  34.33 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  34.76 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  32.35 
 
 		 363 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 370 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 373 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  28.22 
 
 		 318 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 		 348 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 		 321 aa  99  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 349 aa  99  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 348 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  31.39 
 
 		 381 aa  96.7  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 348 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 348 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.84 
 
 		 319 aa  92.8  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 352 aa  92.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 		 348 aa  92  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  27.91 
 
 		 357 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 488 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  26.38 
 
 		 391 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 348 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  32.21 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 319 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  28.14 
 
 		 373 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 348 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 344 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 		 353 aa  89.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  27.4 
 
 		 348 aa  89  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 348 aa  89  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 627 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 342 aa  88.6  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  26.39 
 
 		 673 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 645 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  26.39 
 
 		 673 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  26.39 
 
 		 673 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  26.75 
 
 		 665 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  23.5 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  28.5 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  28.5 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 313 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 348 aa  85.9  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 319 aa  85.9  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  25.48 
 
 		 660 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  28.97 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  25.48 
 
 		 659 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  27.7 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  26.6 
 
 		 624 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  25 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 712 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 712 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  23.44 
 
 		 672 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  23.44 
 
 		 672 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  23.44 
 
 		 672 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  23.44 
 
 		 672 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  23.92 
 
 		 659 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  23.44 
 
 		 672 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  23.44 
 
 		 672 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 628 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 1015 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.63 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>