More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2381 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
336 aa  691    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.35 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 
319 aa  132  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.4 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  33.81 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 
255 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
321 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  29.69 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 
322 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
347 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
348 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
348 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
289 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
348 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
348 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  29.32 
 
 
348 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
348 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 
233 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
348 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
348 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
348 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  32.16 
 
 
349 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 
275 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  29.05 
 
 
233 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 
234 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  29.05 
 
 
233 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 
264 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
319 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 
352 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
254 aa  102  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  30.31 
 
 
297 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
645 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
298 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  29.24 
 
 
391 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 
488 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 
426 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 
224 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 
615 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 
615 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 
273 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
342 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  23.05 
 
 
295 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 
415 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 
627 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  30.9 
 
 
357 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
1001 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
274 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  25.67 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 
510 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 
401 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.25 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  21.67 
 
 
253 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 
278 aa  93.6  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.64 
 
 
409 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.64 
 
 
409 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  27.8 
 
 
256 aa  93.2  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 
373 aa  92.8  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  26.64 
 
 
409 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  24.3 
 
 
357 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  24.11 
 
 
264 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  25.44 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 
407 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 
262 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.91 
 
 
409 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  27.12 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  21.28 
 
 
249 aa  90.1  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  26.23 
 
 
409 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  26.23 
 
 
409 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  26.23 
 
 
409 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  26.19 
 
 
238 aa  89.7  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 
238 aa  89.7  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  26.23 
 
 
409 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 
626 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  26.78 
 
 
417 aa  89.4  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  26.78 
 
 
417 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 
437 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 
239 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  23.36 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
1015 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 
437 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  23.91 
 
 
266 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>