298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1402 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  56.64 
 
 		 256 aa  315  5e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  35.47 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  35.77 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  35.47 
 
 		 273 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  35.47 
 
 		 273 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  34.59 
 
 		 273 aa  165  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  32.96 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  34.23 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  35.45 
 
 		 273 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  35.45 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  31 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  34.83 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  34.83 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  32.6 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35.17 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  31.97 
 
 		 373 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 401 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.99 
 
 		 409 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.4 
 
 		 409 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 407 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  30.17 
 
 		 409 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 409 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  30.17 
 
 		 409 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 409 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.17 
 
 		 409 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  30.17 
 
 		 409 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  27.98 
 
 		 409 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  28.22 
 
 		 409 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.22 
 
 		 407 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  30.22 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.75 
 
 		 409 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 426 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  27.41 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  33.73 
 
 		 366 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 415 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 373 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 437 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  28.51 
 
 		 417 aa  92.8  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  28.51 
 
 		 417 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 		 383 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 659 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 697 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 697 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  25.63 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 698 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 660 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 659 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 673 aa  86.7  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  26.89 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  24.71 
 
 		 640 aa  85.5  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  24.08 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  28.69 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  26.05 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.79 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  26.42 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  26.32 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  28.88 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 615 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 615 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  25.33 
 
 		 724 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  28.09 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1756  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 712 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 697 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  24.39 
 
 		 665 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 712 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 697 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  22.36 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  21.21 
 
 		 695 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  24.6 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  24.6 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  25.19 
 
 		 673 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  25.19 
 
 		 673 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  25.19 
 
 		 673 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>