275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0340 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 273 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  99.27 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  99.27 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  98.9 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  64.6 
 
 		 273 aa  362  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  64.6 
 
 		 273 aa  361  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  64.6 
 
 		 273 aa  361  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  64.6 
 
 		 273 aa  361  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  65.19 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  43.61 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  43.27 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  41.26 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  40.14 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  39.78 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  41.54 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  35.45 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  35.11 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  25.57 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  34.97 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 		 373 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  25 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 271 aa  92  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  28.35 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  28.18 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 224 aa  89  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  27.31 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  26.01 
 
 		 712 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 371 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  26.01 
 
 		 712 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 319 aa  86.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.95 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 697 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  26.01 
 
 		 724 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  28.92 
 
 		 665 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 697 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  27.63 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 		 695 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  29.68 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  23.63 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 697 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 697 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  23.98 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 697 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.03 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 660 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  28.02 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 659 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 		 510 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  28.02 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  23.87 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 659 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.02 
 
 		 407 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.02 
 
 		 409 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  22.57 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  25.71 
 
 		 624 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 628 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.02 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  24.05 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.45 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  25.25 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.59 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 1001 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  24.43 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  26.94 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  26.94 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>