212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4842 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  83.88 
 
 		 724 aa  1218    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  54.98 
 
 		 697 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  54.48 
 
 		 695 aa  777    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  53.87 
 
 		 697 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  54.96 
 
 		 697 aa  770    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 712 aa  1465    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  55.28 
 
 		 697 aa  780    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  54.96 
 
 		 697 aa  770    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  55.28 
 
 		 698 aa  776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 712 aa  1465    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  43.63 
 
 		 659 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  43.79 
 
 		 660 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  43.63 
 
 		 659 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  44.03 
 
 		 640 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  45.18 
 
 		 665 aa  522  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  43.83 
 
 		 673 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  44.33 
 
 		 671 aa  515  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  43.83 
 
 		 673 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  43.83 
 
 		 673 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  44.62 
 
 		 671 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 		 673 aa  498  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  39.3 
 
 		 672 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 		 672 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  39.15 
 
 		 672 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  42.99 
 
 		 628 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  39.3 
 
 		 672 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  39.3 
 
 		 672 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  39.44 
 
 		 672 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  39.3 
 
 		 672 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  41.05 
 
 		 624 aa  469  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  39.63 
 
 		 684 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  30.64 
 
 		 373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 319 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  25.59 
 
 		 645 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 296 aa  90.5  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  28.44 
 
 		 273 aa  90.5  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  28.44 
 
 		 273 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  28.44 
 
 		 273 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.54 
 
 		 258 aa  89.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 		 278 aa  89  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  24.81 
 
 		 256 aa  89  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  28 
 
 		 273 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  24.91 
 
 		 273 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  24.91 
 
 		 273 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  27 
 
 		 296 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  26.01 
 
 		 273 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 278 aa  86.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  25.18 
 
 		 273 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.16 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.16 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 264 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 264 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  25.87 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  25 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 615 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 615 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  23.93 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  25.2 
 
 		 273 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 627 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  26.89 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  23.38 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  25.18 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 		 305 aa  77  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 		 274 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 354 aa  77  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  27.06 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  23.64 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  23.61 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  23.61 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  28.45 
 
 		 318 aa  73.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  26.38 
 
 		 590 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  23.83 
 
 		 273 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  37.04 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  25.46 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  25.46 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  23.45 
 
 		 256 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  23.85 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  23.85 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 254 aa  69.3  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  24.09 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  23.33 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  26.4 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  24.09 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  23.33 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 548 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  24.33 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  24.36 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>