274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0060 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 
273 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  99.63 
 
 
273 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 
273 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  96.34 
 
 
273 aa  560  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  69.96 
 
 
273 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  64.6 
 
 
273 aa  363  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  64.6 
 
 
273 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  64.6 
 
 
273 aa  361  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  64.23 
 
 
273 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  45.28 
 
 
276 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  44.57 
 
 
276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  43.18 
 
 
276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  38.97 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  39.85 
 
 
284 aa  211  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  39.48 
 
 
284 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  35.47 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  37.12 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 
270 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  31.42 
 
 
373 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  36.42 
 
 
366 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 
319 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
336 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 
319 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  26.79 
 
 
265 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 
279 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
272 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 
373 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  25.65 
 
 
266 aa  95.9  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  33.54 
 
 
371 aa  95.9  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  27.62 
 
 
724 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  29.86 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  29.86 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  27.02 
 
 
665 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
712 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
712 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 
298 aa  89.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 
255 aa  89  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
673 aa  89  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 
697 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 
697 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  27.31 
 
 
318 aa  88.6  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  27.76 
 
 
624 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 
697 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.46 
 
 
258 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 
698 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  25.76 
 
 
348 aa  86.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
274 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
401 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 
660 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 
659 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 
697 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 
695 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 
659 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 
697 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  22.88 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  27.67 
 
 
671 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 
348 aa  82  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.69 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.05 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  26.23 
 
 
671 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  26.29 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  26.29 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  25.57 
 
 
510 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  28.84 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.76 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 
348 aa  79  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  26.64 
 
 
409 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  25.35 
 
 
640 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  26.64 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.35 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.64 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  25.93 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
342 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  23.61 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.35 
 
 
409 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>