More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0504 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  57.25 
 
 		 295 aa  306  3e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  41.53 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  37.05 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  33.33 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  32.57 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  37.88 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  34.25 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  33.79 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  33.77 
 
 		 360 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  33.77 
 
 		 360 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  34.21 
 
 		 360 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 		 360 aa  95.9  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  34.21 
 
 		 360 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 255 aa  95.9  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 358 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  34.35 
 
 		 361 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 274 aa  92  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 1015 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  30.45 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0362  polysaccharide deacetylase-like protein  32.89 
 
 		 360 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 297 aa  89  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0315  polysaccharide deacetylase-like protein  32.89 
 
 		 360 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  32.05 
 
 		 373 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0330  polysaccharide deacetylase-like protein  32.89 
 
 		 360 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  27.78 
 
 		 590 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 510 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0302  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  28.94 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 		 673 aa  85.9  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  34.67 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  34.67 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 645 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  28.09 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0316  polysaccharide deacetylase-like protein  30.26 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0363  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0331  polysaccharide deacetylase-like protein  30.26 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  27.31 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0303  polysaccharide deacetylase-like protein  30.26 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  26.27 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  26.27 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 1001 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1802  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 627 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 		 660 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 		 659 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 		 689 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  25.81 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 659 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 		 548 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 		 548 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  27.49 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  26.84 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  24.31 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>