164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1802 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1802  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 240 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0767  hypothetical protein  31.03 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  30.56 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 645 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 627 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  26.84 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  25.5 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  25.73 
 
 		 624 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  25.47 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  28.12 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  31.94 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  29.61 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  30.43 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  30.43 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  30.43 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.07 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  31.17 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.07 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  25.11 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  21.13 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  25 
 
 		 640 aa  62  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  27.59 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  27.59 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  20.57 
 
 		 284 aa  62  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  25.29 
 
 		 673 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 510 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  25.29 
 
 		 673 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  25.29 
 
 		 673 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  31.47 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  30.14 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  24.87 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  25 
 
 		 671 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  23.38 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  27.59 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  25 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  27.65 
 
 		 590 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  27.73 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 673 aa  58.5  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  26.59 
 
 		 672 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 		 672 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  24.89 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  26.59 
 
 		 672 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  26.59 
 
 		 672 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  26.59 
 
 		 672 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  26.59 
 
 		 672 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 712 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  26.01 
 
 		 672 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  41.33 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 712 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 		 1015 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  28.07 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  28.07 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  23.94 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  29.05 
 
 		 360 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0316  polysaccharide deacetylase-like protein  24.28 
 
 		 367 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0331  polysaccharide deacetylase-like protein  24.28 
 
 		 367 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0363  polysaccharide deacetylase  24.28 
 
 		 367 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  28.38 
 
 		 360 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  23.23 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0303  polysaccharide deacetylase-like protein  24.28 
 
 		 367 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  23.96 
 
 		 319 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  20.79 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  21.05 
 
 		 695 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  20.79 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  21.29 
 
 		 628 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 322 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  22.71 
 
 		 336 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  23.42 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  28.78 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 697 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  25 
 
 		 684 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 402 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  24.27 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  22.49 
 
 		 697 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  24.56 
 
 		 724 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>