181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2204 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 402 aa  822    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  31.31 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3402  hypothetical protein  30.39 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1756  polysaccharide deacetylase  23.15 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 		 278 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1226  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  24.27 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  31.14 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  25.75 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  31.01 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  29.94 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  26.43 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 548 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 548 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  32.06 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  31.21 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 		 1001 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  33.59 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  27.78 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  30.82 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  32.09 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  31.88 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  30.6 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  32.82 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  30.37 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  30.37 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  30.37 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  30.6 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  32.28 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  31.82 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 244 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0290  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  29.69 
 
 		 306 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  27.56 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  29.69 
 
 		 306 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  37.16 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  29.03 
 
 		 671 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  40.24 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 		 251 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 689 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 1015 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  28.23 
 
 		 671 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  22.86 
 
 		 339 aa  53.9  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 697 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 370 aa  53.5  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  28.97 
 
 		 295 aa  53.1  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  28.12 
 
 		 256 aa  53.1  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  28.33 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 264 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 697 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  24.18 
 
 		 590 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  28.23 
 
 		 673 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  28.23 
 
 		 673 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  28.23 
 
 		 673 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  40.91 
 
 		 327 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 673 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1802  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 240 aa  51.6  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  53.85 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 255 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  38.98 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 626 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 697 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 697 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 		 283 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 698 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 239 aa  50.4  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  30.34 
 
 		 277 aa  50.4  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  30.88 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  30.88 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 645 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 659 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>