154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0290 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0290  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 322 aa  671    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  25.16 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  25.68 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  24.52 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1756  polysaccharide deacetylase  22.29 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  21.47 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  25.18 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1226  polysaccharide deacetylase  22.19 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  28.57 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  32.67 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  32.67 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  32.67 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  19.8 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  30.33 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  31.68 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  29.67 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  23.38 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  23.38 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  22.88 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.09 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.02 
 
 		 409 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  26.09 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3402  hypothetical protein  24.19 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.72 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.72 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  27.72 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  27.72 
 
 		 273 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  24.03 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  29.52 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  51.02 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 249 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  22.48 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  32.99 
 
 		 409 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 313 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 354 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  23.67 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  30.19 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  32.1 
 
 		 590 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.84 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.84 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.93 
 
 		 409 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  28 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  21.35 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  28 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  34.29 
 
 		 437 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  30.93 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  43.82 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 401 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  32.86 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 415 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 234 aa  49.7  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  32.86 
 
 		 378 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  31.43 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  31.43 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  31.43 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  23.91 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  20.41 
 
 		 712 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  31.43 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  20.41 
 
 		 712 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 426 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 645 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 344 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 264 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  33.33 
 
 		 239 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 239 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 254 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  21.07 
 
 		 628 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  20.96 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  32.91 
 
 		 417 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  44.44 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0625  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0292231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>