255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2013 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 386 aa  799    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  30.9 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 		 672 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 337 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.27 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  27.59 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 400 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 400 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  25.34 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 351 aa  99.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 350 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  26.71 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  27.79 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 		 349 aa  94  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 353 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 348 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  21.74 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  37.29 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  26.67 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  26.4 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 352 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  25.59 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  24.08 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  23.38 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  24.57 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  36.29 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  23.43 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  25.09 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  25.6 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  24.51 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  25.09 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  23.24 
 
 		 352 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  24.18 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1756  polysaccharide deacetylase  46.97 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  24.8 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  24.8 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25.54 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  24.8 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  32.41 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  23.29 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  24.4 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  20.68 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25.27 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  34.94 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  34.94 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  23.81 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  24.19 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  25.27 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  34.34 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  21.54 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  34.68 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  25.1 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  21.81 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>