280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1729 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
316 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  36.1 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 
324 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  30.92 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 
322 aa  109  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
354 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 
337 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 
368 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  27.79 
 
 
386 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  29.64 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  31.99 
 
 
408 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 
350 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  31.23 
 
 
353 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 
351 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
339 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
672 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
397 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 
398 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  28.41 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 
349 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
398 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 
352 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 
400 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  24.52 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  48.39 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  39.45 
 
 
278 aa  77  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  31.33 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.17 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  41.35 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  36.27 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  33.04 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  33.04 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  24.92 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  44.32 
 
 
238 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  44.32 
 
 
238 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  21.43 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  29.58 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  39.36 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  37.23 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
233 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 
234 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  22.78 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  25.16 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  28.68 
 
 
239 aa  62.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  35.24 
 
 
319 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  33.64 
 
 
363 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 
244 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 
256 aa  62.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  39.64 
 
 
321 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  37.08 
 
 
239 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  30.19 
 
 
391 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  39.08 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  37.23 
 
 
276 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  34.04 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 
253 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  30.08 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 
353 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  31.25 
 
 
357 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  32.34 
 
 
624 aa  59.3  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  39.08 
 
 
233 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>