169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5866 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 350 aa  677    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  82.34 
 
 		 351 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  72.93 
 
 		 350 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  72.36 
 
 		 350 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  72.08 
 
 		 350 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  68.64 
 
 		 353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  47.41 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  45.69 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  45.4 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  44.57 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  47.43 
 
 		 352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  45.71 
 
 		 352 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  44.86 
 
 		 352 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  45.57 
 
 		 362 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  42.5 
 
 		 352 aa  222  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  41.77 
 
 		 345 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  42.59 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  39.56 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  42.12 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  37.05 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  38.11 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  39.01 
 
 		 348 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  36.01 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 672 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  35.24 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 398 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 		 398 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  36.82 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 		 386 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 337 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  38.68 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  38.21 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.14 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  27.11 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  23.57 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  23.83 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  21.66 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 408 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  19.34 
 
 		 271 aa  67  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 645 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  26.25 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  28.68 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  32.63 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  38.33 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  29.84 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  30.7 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  40.82 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  40.82 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  38.61 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  23.36 
 
 		 590 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  32.99 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.46 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  26.3 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  37.63 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>