138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0854 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 294 aa  607  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  66.67 
 
 		 294 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  65.97 
 
 		 288 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  26.23 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  24.57 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  25.63 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  27.92 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  25.91 
 
 		 590 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  24.82 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  22.45 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  22.04 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  25.28 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  27 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  22.95 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  26.82 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.73 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  22.26 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  23.94 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  24.33 
 
 		 672 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 		 645 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 352 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.81 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 		 398 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  21.89 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  33.72 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  23.19 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  25.55 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  24.92 
 
 		 408 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  23.44 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 350 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 		 426 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  27.03 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.64 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  22.01 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  27.03 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  27.03 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  27.03 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  26.92 
 
 		 437 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  27.03 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  23.68 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  23.99 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  23.22 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  21.33 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>