200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1604 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  96.57 
 
 		 350 aa  666    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 350 aa  690    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  87.71 
 
 		 350 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  75.07 
 
 		 353 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  69.32 
 
 		 351 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  72.36 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  46.86 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  46.72 
 
 		 352 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  46.15 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  47.41 
 
 		 352 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  44.8 
 
 		 352 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  43.02 
 
 		 352 aa  270  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  43.06 
 
 		 368 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  44.65 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  42.45 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  41.48 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  37.69 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  36.19 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  38.26 
 
 		 349 aa  179  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  36.25 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  35.33 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  36.16 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 672 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  30.9 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 344 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 386 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  24.73 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  29.83 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  23.2 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  28.46 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 645 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  28.48 
 
 		 238 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  28.48 
 
 		 238 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.65 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  32.36 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  22.5 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  24.03 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  28.93 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  31.27 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  20.7 
 
 		 271 aa  67  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  23 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  30.43 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  25.8 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  40 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  29.13 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  29.04 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>