131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4976 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 368 aa  748    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  42.52 
 
 		 349 aa  222  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  35.74 
 
 		 352 aa  185  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  35.41 
 
 		 352 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  33.43 
 
 		 368 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  33.43 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  33.43 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 362 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 353 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  31.95 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  36.01 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  32.59 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 324 aa  92.8  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  25.72 
 
 		 590 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.25 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  25.18 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  28.48 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.45 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  24.41 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 672 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  23.83 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  26.57 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 510 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  26.5 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  47.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  47.14 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  23.76 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  34.82 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  37.08 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  37.66 
 
 		 224 aa  57  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  24.11 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  20.44 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  36.63 
 
 		 238 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  36.63 
 
 		 238 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  40.85 
 
 		 233 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  23.82 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  34.91 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  22.48 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 627 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 256 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  25.09 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 265 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  34.72 
 
 		 363 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  38.57 
 
 		 283 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>