102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4603 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 353 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  54.33 
 
 		 350 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  54.01 
 
 		 348 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  54.97 
 
 		 348 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 352 aa  226  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  39.63 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 368 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  39.63 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 352 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 352 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  36.94 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  36.09 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  38.49 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  38.41 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  37.03 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  36.19 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  37.05 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  31.53 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  29.25 
 
 		 349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.56 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 672 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  23.6 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  20.6 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  23.13 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 278 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  21.93 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  36.78 
 
 		 645 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 270 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  29.34 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  25.16 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  22.59 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  24.45 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  33.6 
 
 		 289 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 627 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  30.23 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  21.03 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 224 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 1015 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  18.35 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 615 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 615 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 488 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  29.07 
 
 		 233 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  25.74 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  30.19 
 
 		 590 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 598 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0376  hypothetical protein  27.85 
 
 		 119 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.565558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  30.55 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  32.69 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  27 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>