47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0376 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0376  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  249  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.565558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  31.58 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 353 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.32 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 339 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 		 289 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 344 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 672 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 318 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 339 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 350 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 354 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 		 344 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 		 348 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 350 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 350 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 353 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 333 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 352 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  27.78 
 
 		 314 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 398 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 398 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 		 353 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 398 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 274 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 350 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  29.52 
 
 		 310 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 626 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 362 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 348 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 351 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 324 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 337 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 1015 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 336 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.85 
 
 		 348 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 321 aa  40.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  24.27 
 
 		 324 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 305 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 		 337 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>