251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2336 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 339 aa  698    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 398 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 398 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.77 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 408 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 672 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  32.1 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  28.48 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  26.6 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 		 322 aa  92.8  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 350 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 271 aa  90.1  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  30.12 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  26.3 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  26.23 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  28.2 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  22.67 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  26.98 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  37.14 
 
 		 254 aa  72  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  39.42 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  24.41 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  24.56 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  24.56 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  25.26 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  32.69 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  33.01 
 
 		 590 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  36.56 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  28.31 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  22.26 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  35.9 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 		 1015 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  21.68 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  37.35 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  30.43 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  37.35 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  24.33 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  32.35 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  23.32 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  25.47 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  23.32 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>