194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2761 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  94.97 
 
 
398 aa  712    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
398 aa  776    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  94.47 
 
 
398 aa  709    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  62.84 
 
 
408 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  69.81 
 
 
397 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  68.73 
 
 
400 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  68.73 
 
 
400 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
339 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  33.23 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 
386 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 
337 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 
353 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.71 
 
 
337 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  31.23 
 
 
339 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 
322 aa  96.7  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.71 
 
 
294 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 
321 aa  92.8  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 
672 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 
316 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
351 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 
345 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  31.35 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 
282 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
324 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  33.22 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  30.82 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  32.55 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  23.44 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
348 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 
305 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
350 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 
224 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 
255 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
645 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  31.27 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  36.8 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  36.8 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 
294 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  43.9 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  32.19 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 
251 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 
309 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
598 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 
279 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 
274 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  26.26 
 
 
338 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 
234 aa  62.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
278 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 
342 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 
271 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  30.41 
 
 
349 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  23.67 
 
 
327 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 
289 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
330 aa  59.7  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  32.43 
 
 
233 aa  59.7  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 
270 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  31.53 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.53 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  31.53 
 
 
233 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 
659 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  27.83 
 
 
276 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
238 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  35.45 
 
 
238 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 
660 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.3 
 
 
289 aa  56.6  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  24.46 
 
 
659 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
1015 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  23.05 
 
 
328 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
510 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>