54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0240 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 330 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  38.31 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  27.09 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2811  hypothetical protein  30.1 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  28.4 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  30.42 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33060  hypothetical protein  29.61 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000176969  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  23.23 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  21.58 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  21.85 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 		 672 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 349 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 		 354 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  27.45 
 
 		 590 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  41.86 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  48.89 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  26.17 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.17 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  25.63 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>