146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5271 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 352 aa  714    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  75 
 
 		 352 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  74.72 
 
 		 352 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  66.76 
 
 		 368 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  66.38 
 
 		 352 aa  485  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  66.76 
 
 		 352 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  63.92 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  47.7 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  47.99 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  45.4 
 
 		 353 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  47.41 
 
 		 350 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  45.56 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  43.69 
 
 		 362 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  47.43 
 
 		 350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  40.77 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 		 347 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  37.57 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  38.97 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 348 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  41.32 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 322 aa  92.8  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  25.61 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 672 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  23.47 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  26.93 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  23.51 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  24.09 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  24.08 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  21.62 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.36 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  20.76 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  27.6 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  30.55 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  24.25 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.97 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  31.15 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3402  hypothetical protein  33.06 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 645 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 322 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 272 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 256 aa  53.5  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 488 aa  53.5  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 		 1015 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  43.66 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  35.05 
 
 		 238 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 238 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  36.56 
 
 		 239 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 239 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  33.8 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>