254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2028 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 318 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  23.67 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  26.38 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  28.62 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 		 672 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  24.25 
 
 		 352 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  24.74 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  25.57 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  42.16 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  23.53 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  23.51 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  26.01 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  23.2 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  22.92 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  24.61 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  24.11 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  23.43 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  24.09 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  36.7 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  36.7 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  23.62 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  23.23 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  24.1 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  39.05 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  22.71 
 
 		 590 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  23 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  23.73 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  23.73 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  42.39 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  23.34 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  20.82 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  23.42 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  23.9 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  22.96 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  23 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  37.14 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  30.61 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  23.4 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  23 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  23.4 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  23.4 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  25.34 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  34.69 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  38.3 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  23.6 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  20.6 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  21.61 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  28.25 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  35.58 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  35 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>