169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0752 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 352 aa  720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  67.24 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  66.19 
 
 		 352 aa  500  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  66.76 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  65.62 
 
 		 352 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  66.76 
 
 		 352 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  65.34 
 
 		 352 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  46.86 
 
 		 350 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  46 
 
 		 353 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  46 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  46.86 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  45.85 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  47.41 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  43.65 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  39.63 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  39.34 
 
 		 352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  37.65 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 348 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  36.48 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  39.41 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  37.54 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 		 322 aa  99.8  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  28.94 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 		 672 aa  89.4  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  34.73 
 
 		 400 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  34.73 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  24.86 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  23.86 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  24.13 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  26.6 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.46 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  25.3 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  36.3 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  23.98 
 
 		 271 aa  67  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 255 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  20.64 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  38.2 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  26.64 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  23.02 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  29.7 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  29.7 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  22.15 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  37.14 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  37.14 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  39.68 
 
 		 645 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  30.77 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  33.33 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  38.71 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 627 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  38.71 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 		 233 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  32.93 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 275 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 		 249 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 510 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 276 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>