137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1279 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
348 aa  710    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  56.76 
 
 
347 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  42.44 
 
 
352 aa  262  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  41.42 
 
 
345 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  40.35 
 
 
345 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  38.35 
 
 
349 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  34.23 
 
 
352 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 
352 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 
352 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  35.17 
 
 
368 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
350 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 
351 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
362 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  35.1 
 
 
350 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
350 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 
353 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  28.66 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 
349 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 
349 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 
353 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 
368 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 
408 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  24 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 
339 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  27 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.06 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
672 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  23.99 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  24.83 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  23.65 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  24.5 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  25.08 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  24.05 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  24.89 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  23.23 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  22.96 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  28 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 
386 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 
288 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  22.39 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  23.72 
 
 
353 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  23.18 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  21.56 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  22.15 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 
294 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
344 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  22.28 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  18.1 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 
224 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 
274 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 
285 aa  49.7  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 
321 aa  49.3  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.66 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  31.18 
 
 
261 aa  49.3  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  30 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  26.53 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 
266 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 
328 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  19.41 
 
 
265 aa  47  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
645 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  23.85 
 
 
297 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28.21 
 
 
306 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  28.21 
 
 
306 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0375  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 
323 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0881899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 
342 aa  46.2  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.577134 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>