187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2015 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 333 aa  685    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  58.56 
 
 		 351 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33060  hypothetical protein  37.46 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000176969  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2811  hypothetical protein  35.91 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 		 330 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 344 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  29.56 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  28.62 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 386 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 		 400 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 672 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  28.78 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.57 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  26.6 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  26.33 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  23.59 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  23.36 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  24.05 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  23.55 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  24.47 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 1015 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  34.31 
 
 		 590 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  26.26 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  20.48 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  22.92 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  24.63 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  22.78 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  23.13 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  23.97 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  25.4 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  22.22 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 		 234 aa  57  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  29.46 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  25.78 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.27 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.27 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  27.42 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  22.97 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  24.8 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  25.67 
 
 		 371 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 510 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0290  polysaccharide deacetylase  23.67 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>