277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3105 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
336 aa  674    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 
371 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  36.84 
 
 
273 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  36.84 
 
 
273 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  36.84 
 
 
273 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  36.84 
 
 
273 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  36.6 
 
 
273 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  24.62 
 
 
366 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  22.01 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  40.83 
 
 
373 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  31.13 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  31.13 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  31.13 
 
 
273 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 
282 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  31.72 
 
 
273 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 
264 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 
321 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  26.43 
 
 
318 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 
276 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  34.34 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  26.58 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  36.72 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.33 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 
712 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 
712 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  36.5 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  29.66 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  40.62 
 
 
724 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  37.88 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  33.97 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  29.49 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  37.3 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  37.3 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 
510 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  30.26 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0375  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0881899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
627 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  33.55 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
645 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  21.8 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  36.89 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  33.88 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  30 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  33.33 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  22.36 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  29.61 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 
548 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3402  hypothetical protein  26.63 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377712  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 
548 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
697 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
697 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
698 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 
695 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1756  polysaccharide deacetylase  26.33 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 
615 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 
615 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  20.06 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  23.77 
 
 
258 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  23.53 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 
697 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 
353 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  33.08 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  28.68 
 
 
640 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 
697 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  34.26 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>