219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2295 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  100 
 
 		 289 aa  590  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  64.71 
 
 		 290 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  64.71 
 
 		 290 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0711  xylanase/chitin deacetylase  29.79 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.485406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 659 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 660 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 		 659 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  32.2 
 
 		 373 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 628 aa  96.3  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  24.81 
 
 		 624 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  26 
 
 		 673 aa  92.4  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.52 
 
 		 409 aa  92  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  28.5 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  32.66 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.68 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  28.64 
 
 		 409 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 409 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 409 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  28.64 
 
 		 409 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.92 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.05 
 
 		 409 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.05 
 
 		 409 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 488 aa  86.3  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  28.57 
 
 		 409 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.76 
 
 		 409 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  27.76 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  27.76 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.76 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 548 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 548 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 626 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  21.58 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  25.93 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  22 
 
 		 671 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  25.93 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  25.93 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  25.48 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 712 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 712 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  25.93 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  21.85 
 
 		 671 aa  75.5  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 457 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  25.46 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  22.07 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  21.62 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  24.82 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  21.62 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  21.62 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  21.62 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  20.79 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  20.79 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  21.62 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  22.95 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  21.62 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  23.36 
 
 		 673 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  22.76 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  23.36 
 
 		 673 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  23.36 
 
 		 673 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  24.24 
 
 		 724 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  24.36 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  24 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  28 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  27.56 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06580  predicted xylanase/chitin deacetylase  25 
 
 		 629 aa  69.3  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  27.93 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  20.94 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  25.45 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  20.55 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  31.65 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  27.96 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0150  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  20.82 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  20.82 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  27.72 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  25.21 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  21.26 
 
 		 672 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>