229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2459 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 318 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.75 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 		 351 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 408 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 386 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  24.28 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 368 aa  89  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 322 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 398 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  24 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  24.26 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  24.73 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 		 398 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 352 aa  85.9  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  20.07 
 
 		 339 aa  85.9  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 366 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  23.47 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  24 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 672 aa  79.3  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  22.97 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  22.38 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  25.48 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  23.6 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  23.04 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  25.08 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  29.68 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  38.64 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  33.33 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  37.14 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  21.24 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  21.83 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  39.33 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  23.6 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  40.54 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  40.54 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  34.31 
 
 		 590 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  35.95 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  38.54 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  23.67 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  21.82 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  21.82 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  22 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  35.11 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  35.96 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  21.75 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1226  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  35.23 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1756  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  23.37 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  40.24 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>