125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0595 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 345 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  86.09 
 
 		 345 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  54.36 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  45.43 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  44.93 
 
 		 347 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  40.35 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  40.84 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  39.21 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  41.48 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  41.48 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  40.31 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  38.82 
 
 		 352 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  40.54 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  37.65 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  38.26 
 
 		 362 aa  199  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  37.87 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  38.97 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  41.59 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  29.62 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 672 aa  85.9  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.96 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  25.55 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  23 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  26.65 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  29.62 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  29.62 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  25 
 
 		 590 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  21.54 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  27.02 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  23.97 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  20.34 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  23.88 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  24.3 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  22.5 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 		 272 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 309 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  20.3 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  23.34 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 660 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 659 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  33.67 
 
 		 233 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  23 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  23 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  33.67 
 
 		 233 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  23.23 
 
 		 724 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  20.56 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  29.45 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 357 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 305 aa  46.2  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  31.17 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 659 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  23.08 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  26.83 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  28.17 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  22.86 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>