244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1557 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 322 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  48.98 
 
 		 318 aa  265  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  45.03 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  47.81 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  44.92 
 
 		 672 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  44.92 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  48.83 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 408 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 		 352 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 		 398 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  30.82 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 352 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  28.89 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  30.24 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  26.76 
 
 		 590 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.17 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  29.04 
 
 		 352 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 345 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  30.9 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  27.95 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  27.84 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  24.03 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  30.7 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  29.04 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  38.4 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  25.77 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  34.64 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  29.25 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  30.42 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  38.1 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  21.24 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  23.2 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  34.91 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  42.42 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  34.91 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  24.56 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 598 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  24.67 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>