207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2823 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
400 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  94.91 
 
 
397 aa  713    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  99.25 
 
 
400 aa  755    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  63.57 
 
 
408 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  68.73 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  64.75 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  64.75 
 
 
398 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 
318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 
339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 
316 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 
353 aa  106  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
386 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 
337 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 
337 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
339 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
348 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 
672 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  30.79 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 
333 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  34.73 
 
 
352 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.68 
 
 
294 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  33.21 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
350 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  36.64 
 
 
255 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  34.24 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 
598 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  34.75 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  23.42 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  29.62 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  36.94 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  39.45 
 
 
321 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  23.79 
 
 
327 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  40.26 
 
 
289 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
279 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  28.1 
 
 
349 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 
256 aa  63.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  43.59 
 
 
239 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 
276 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
270 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 
234 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 
274 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  43.59 
 
 
239 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 
278 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  28.84 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
309 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 
270 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  34.11 
 
 
233 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 
352 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 
330 aa  60.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 
352 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  22.91 
 
 
273 aa  60.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
1015 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 
274 aa  59.7  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 
233 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
352 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  29.09 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
233 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  22.18 
 
 
273 aa  57  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  22.18 
 
 
273 aa  57  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  22.18 
 
 
273 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  40.45 
 
 
253 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 
645 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 
264 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  23.77 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  20.53 
 
 
265 aa  53.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>