220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2642 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 397 aa  759    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  95.54 
 
 		 400 aa  700    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  94.91 
 
 		 400 aa  690    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  65.12 
 
 		 408 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  69.81 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  68.73 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  68.73 
 
 		 398 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 339 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 353 aa  106  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 316 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  28.01 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 672 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 348 aa  93.2  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 321 aa  92.8  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 305 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  28.78 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 316 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.28 
 
 		 294 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 		 352 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  33.79 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  35.69 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  39.69 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  38 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  23.73 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  25.34 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  42.2 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  24.4 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  35.51 
 
 		 590 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  40.26 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  34.88 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  30.67 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 1015 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  41.94 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  28.84 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  34.11 
 
 		 233 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  42.31 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  39.58 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  31.67 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  29.55 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  35.21 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  22.91 
 
 		 273 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  36.52 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  22.18 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  22.18 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  22.18 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 319 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>