171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0148 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 342 aa  699    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  43.27 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  39.24 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  31.41 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  27.51 
 
 		 304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.71 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  26.3 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  26.3 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  44.44 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14351  hypothetical protein  22.86 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  23.88 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  23.33 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  23.1 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  23.65 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  43.33 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  22.68 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  24.56 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  33.61 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  22.73 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  25.16 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 659 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  31.96 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  29.45 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 660 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  24.02 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  33.73 
 
 		 233 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  25.86 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  25.86 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  25.86 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 659 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  22.77 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 255 aa  53.9  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  34.69 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  33.73 
 
 		 233 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  42.11 
 
 		 640 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 598 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  37.35 
 
 		 697 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  37.35 
 
 		 697 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  37.35 
 
 		 698 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 		 249 aa  52.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 282 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  32.41 
 
 		 724 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  35.87 
 
 		 665 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 697 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 695 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  34.74 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 712 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  23.69 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 712 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  25.29 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  25.94 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  28.37 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  32.61 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 697 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  22.61 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  34.62 
 
 		 624 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  47.73 
 
 		 697 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 234 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  42.11 
 
 		 671 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>